Beyond Good & Evil tem lugar no ano 2435 no planeta mineração de Hillys, localizado em uma área remota da galáxia.[12] O arquitetura da cidade em torno do qual o jogo se passa é rústico Europeia no estilo. O mundo em si combina elementos modernos, como o email e cartões de crédito, Com aqueles de ficção científica e fantasia, Tal como e naves espaciais antropomórfico animais convivendo com seres humanos.[13] Quando o jogo começa, Hillys está sob o cerco por alienígenas chamados a "Domz", que raptam seres e quer drenam sua força vital pelo poder ou implantá-los com esporos convertê-los em escravos.[12] Antes da abertura do jogo, uma ditadura militar chamado de "secções" Alpha chegou ao poder em Hillys, prometendo defender a população.[5] No entanto, as secções Alpha parecem incapazes de parar o Domz apesar de suas garantias públicas. Um movimento de resistência, a Rede IRIS, combate as secções Alpha, acreditando ser na liga com o Domz.[14]

Beyond Good & Evil'S principal protagonista, Jade (dublada por Jodi Forrest ), É um jovem fotojornalista. Ela reside em um farol da ilha que funciona como um lar para crianças órfãs por ataques Domz. Pey'j (dublado por David Gasman), Uma criatura javali-like, é "tio" de Jade e figura guardião.[5] Double H, um corpulento operatório IRIS humano, auxilia Jade durante as missões. Ele veste um terno militar questão da armadura em todos os momentos. Secundo, uma inteligência artificial construído na unidade de armazenamento de Jade, o "Synthetic-Atomic-Compressor" (SAC), oferece aconselhamento e "digitaliza" itens. Os principais antagonistas estão a Domz Sumo Sacerdote, que é o principal arquiteto da invasão, e Alpha líder Seções Geral Kehck, que usa propaganda para ganhar a confiança dos Hillyans ', como ele mesmo sequestra os cidadãos para sustentar o Domz.